Одним из основных направлений работы Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический сад – Национальный научный центр РАН» (ФГБУН «НБС-ННЦ») является подготовка научных кадров высшей квалификации.

Аспирантура в Никитском ботаническом саду была открыта в 1960 г. по специальностям: ботаника, биохимия, физиология растений, энтомология, агропочвоведение, фитопатология, селекция и семеноводство, микология, экология и биотехнология.

В ФГБУН «НБС-ННЦ» с 12 октября 2017 г. открыта АСПИРАНТУРА.  Подготовка научных и научно-педагогических кадров в аспирантуре осуществляется по двум направлениям:
• 06.06.01 – Биологические науки
• 35.06.01 – Сельское хозяйство.

В ФГБУН «НБС-ННЦ» действуют ДИССЕРТАЦИОННЫЕ СОВЕТЫ по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук:

с 24 мая 2017 г. открыт диссертационный совет 24.1.199.01 (Д 900.011.01) по научным специальностям:

• 1.5.9 — Ботаника (биологические науки) и  1.5.15 — Экология (биологические науки).

с 17 апреля 2019 г. открыт диссертационный совет Д 900.011.02 по научной специальности

• 06.01.05 — Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений (сельскохозяйственные науки и биологические науки).