Одним из основных направлений работы Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический сад – Национальный научный центр РАН» (ФГБУН «НБС-ННЦ») является подготовка научных кадров высшей квалификации.

Аспирантура в Никитском ботаническом саду была открыта в 1960 г. по специальностям: ботаника, биохимия, физиология растений, энтомология, агропочвоведение, фитопатология, селекция и семеноводство, микология, экология и биотехнология.

В ФГБУН «НБС-ННЦ» с 12 октября 2017 г. открыта АСПИРАНТУРА.  Подготовка научно-педагогических кадров высшей квалификации осуществляется по двум направлениям:
• 06.06.01 – Биологические науки
• 35.06.01 – Сельское хозяйство.

В ФГБУН «НБС-ННЦ» действуют ДИССЕРТАЦИОННЫЕ СОВЕТЫ по защите диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук:

с 24 мая 2017 г. открыт диссертационный совет Д 900.011.01 по научным специальностям:

• 03.02.01 — Ботаника (биологические науки) и  03.02.08 — Экология (биология) (биологические науки).

с 17 апреля 2019 г. открыт диссертационный совет Д 900.011.02 по научной специальности

• 06.01.05 — Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений (сельскохозяйственные науки и биологические науки).